Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisa3Q3UPR0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa3Q3UPR0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa3Q3UPR0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms