Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mcrip1Q3UGS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mcrip1Q3UGS4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms