Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
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Shroom4Q1W617 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Shroom4Q1W617 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
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Shroom4Q1W617 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Shroom4Q1W617 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Shroom4Q1W617 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms