Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss11cQ1JRP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmprss11cQ1JRP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms