Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FOXD1Q16676 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FOXD1Q16676 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms