Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL3Q13618 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL3Q13618 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL3Q13618 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL3Q13618 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL3Q13618 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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