Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TCIRG1Q13488 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms