Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtel1Q0VGM9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms