Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700061G19RikQ08EE8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms