Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnn2Q08093 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms