Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrstQ06666 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms