Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkczQ02956 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkczQ02956 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkczQ02956 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkczQ02956 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkczQ02956 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms