Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cds1P98191 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cds1P98191 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms