Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VldlrP98156 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VldlrP98156 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VldlrP98156 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VldlrP98156 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms