Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx1P83917 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cbx1P83917 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx1P83917 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cbx1P83917 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms