Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG7P83436 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG7P83436 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG7P83436 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG7P83436 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG7P83436 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG7P83436 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG7P83436 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG7P83436 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG7P83436 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG7P83436 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG7P83436 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG7P83436 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG7P83436 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG7P83436 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms