Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms