Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb6P70689 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms