Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabrb3P63080 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabrb3P63080 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabrb3P63080 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabrb3P63080 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabrb3P63080 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabrb3P63080 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms