Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsnl1P62761 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsnl1P62761 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms