Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps11P62281 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps11P62281 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms