Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abce1P61222 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms