Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2fP61219 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms