Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab5bP61021 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab5bP61021 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms