Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ActbP60710 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ActbP60710 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ActbP60710 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ActbP60710 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ActbP60710 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ActbP60710 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ActbP60710 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ActbP60710 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ActbP60710 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms