Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b6P59708 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b6P59708 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms