Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms