Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpm2P58774 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm2P58774 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms