Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm6sf1P58749 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tm6sf1P58749 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms