Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcbp4P57724 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcbp4P57724 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms