Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cks2P56390 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms