Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GferP56213 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GferP56213 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GferP56213 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GferP56213 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GferP56213 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GferP56213 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GferP56213 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GferP56213 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GferP56213 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GferP56213 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GferP56213 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms