Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ephb3P54754 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms