Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad23aP54726 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms