Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab2aP53994 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms