Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms