Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gli1P47806 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gli1P47806 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms