Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apoc1P34928 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms