Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SsbP32067 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SsbP32067 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SsbP32067 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SsbP32067 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SsbP32067 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SsbP32067 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SsbP32067 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SsbP32067 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SsbP32067 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SsbP32067 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SsbP32067 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms