Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Saa4P31532 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Saa4P31532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Saa4P31532 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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