Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprmP28828 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprmP28828 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprmP28828 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprmP28828 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprmP28828 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprmP28828 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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