Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd10P28359 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd10P28359 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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