Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Xrcc5P27641 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Xrcc5P27641 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Xrcc5P27641 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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