Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PdgfraP26618 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PdgfraP26618 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms