Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGFR4P22455 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms