Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb9P20615 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb9P20615 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms