Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl13aP19253 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl13aP19253 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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