Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps6ka1P18653 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka1P18653 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps6ka1P18653 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms