Protein–RNA interactions for Protein: P18111

Cdx1, Homeobox protein CDX-1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx1P18111 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx1P18111 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdx1P18111 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms