Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptan1P16546 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptan1P16546 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms